Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP38Q8NB14 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP38Q8NB14 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms