Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf29Q8N999 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf29Q8N999 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf29Q8N999 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf29Q8N999 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms