Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc73Q8CDM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc73Q8CDM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms