Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp20Q8C6M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp20Q8C6M1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp20Q8C6M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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