Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco3Q8BH01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco3Q8BH01 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco3Q8BH01 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms