Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stkld1Q80YS9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stkld1Q80YS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stkld1Q80YS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stkld1Q80YS9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms