Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvoplQ6PDF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SvoplQ6PDF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SvoplQ6PDF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms