Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Trak1Q6PD31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Trak1Q6PD31 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trak1Q6PD31 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Trak1Q6PD31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Trak1Q6PD31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Trak1Q6PD31 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Trak1Q6PD31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,3 ms