Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkab2Q6PAM0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkab2Q6PAM0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkab2Q6PAM0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prkab2Q6PAM0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab2Q6PAM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms