Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7bQ6P4U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7bQ6P4U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7bQ6P4U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7bQ6P4U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7bQ6P4U0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Thsd7bQ6P4U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Thsd7bQ6P4U0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Thsd7bQ6P4U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thsd7bQ6P4U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Thsd7bQ6P4U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7bQ6P4U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7bQ6P4U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms