Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbf1Q6DFZ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbf1Q6DFZ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbf1Q6DFZ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbf1Q6DFZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbf1Q6DFZ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbf1Q6DFZ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbf1Q6DFZ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbf1Q6DFZ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbf1Q6DFZ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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