Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1opQ66JX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1opQ66JX5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1opQ66JX5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgfr1opQ66JX5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgfr1opQ66JX5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms