Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd33Q63994 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd33Q63994 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd33Q63994 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms