Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx1Q62443 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nptx1Q62443 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms