Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna2Q61301 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctnna2Q61301 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna2Q61301 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna2Q61301 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms