Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GARNL3Q5VVW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GARNL3Q5VVW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GARNL3Q5VVW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GARNL3Q5VVW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GARNL3Q5VVW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms