Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim80Q3V061 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim80Q3V061 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim80Q3V061 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms