Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TWISTNBQ3B726 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TWISTNBQ3B726 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TWISTNBQ3B726 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TWISTNBQ3B726 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TWISTNBQ3B726 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms