Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP4Q15650 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP4Q15650 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIP4Q15650 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIP4Q15650 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIP4Q15650 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms