Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TROAPQ12815 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TROAPQ12815 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROAPQ12815 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TROAPQ12815 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROAPQ12815 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms