Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 VMA2YBR127C 1554 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 PHO3YBR092C 1404 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 YMR206WYMR206W 942 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 IRC5YFR038W 2562 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 YMR074CYMR074C 438 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 YHR131CYHR131C 2553 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 NOG2YNR053C 1461 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 FCY22YER060W-A 1593 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 DLD1YDL174C 1764 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 PGI1YBR196C 1665 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 YCR025CYCR025C 411 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 RPL5YPL131W 894 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 YPT10YBR264C 600 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 TKL2YBR117C 2046 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG17Q06410 DAL4YIR028W 1908 nt6.84□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 RRP43YCR035C 1185 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 PPH22YDL188C 1134 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 MLS1YNL117W 1665 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 SER2YGR208W 930 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 DPH5YLR172C 903 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YNL200CYNL200C 741 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YPR084WYPR084W 1371 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 KNS1YLL019C 2214 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 RPS6AYPL090C 711 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 RPL43AYPR043W 279 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 RPS6BYBR181C 711 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 Q0010Q0010 387 nt6.81□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 HTS1YPR033C 1641 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YGR210CYGR210C 1236 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 THR1YHR025W 1074 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YOL099CYOL099C 492 nt6.8□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 GPA1YHR005C 1419 nt6.79□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YUR1YJL139C 1287 nt6.79□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 ERG27YLR100W 1044 nt6.79□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YPL108WYPL108W 507 nt6.79□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 MSG5YNL053W 1470 nt6.79□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YJL144WYJL144W 315 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 DSC3YOR223W 879 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 YLL058WYLL058W 1728 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG17Q06410 ISC1YER019W 1434 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 ATP2YJR121W 1536 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 HXT2YMR011W 1626 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 SWM1YDR260C 513 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 QCR6YFR033C 444 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 YJL064WYJL064W 396 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 UBP13YBL067C 2244 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 TUF1YOR187W 1314 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 AVT4YNL101W 2142 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 SEN2YLR105C 1134 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 SPS1YDR523C 1473 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 RGD2YFL047W 2145 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 CUE4YML101C 354 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 RGT2YDL138W 2292 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 SLA2YNL243W 2907 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 CEF1YMR213W 1773 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 PEX31YGR004W 1389 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 TOS1YBR162C 1368 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 PSA1YDL055C 1086 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 MGM101YJR144W 810 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 AIM33YML087C 939 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 CTA1YDR256C 1548 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 PAC2YER007W 1557 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 YPL247CYPL247C 1572 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 HAL5YJL165C 2568 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 DYS1YHR068W 1164 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 PAU19YMR325W 375 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 YER156CYER156C 1017 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 YBR284WYBR284W 2394 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG17Q06410 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 GCN3YKR026C 918 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 ADH5YBR145W 1056 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 PET117YER058W 324 nt6.7□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 RIO1YOR119C 1455 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 HPT1YDR399W 666 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 ERP2YAL007C 648 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 SKP1YDR328C 585 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 HIS1YER055C 894 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 YJR107WYJR107W 987 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 CCW12YLR110C 402 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 SDH8YBR269C 417 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 AIM3YBR108W 2844 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 PET18YCR020C 648 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 CYC8YBR112C 2901 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 YIL055CYIL055C 1884 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 YIL168WYIL168W 384 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 YKR032WYKR032W 315 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 FCY1YPR062W 477 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 SES1YDR023W 1389 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 NAF1YNL124W 1479 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 HGH1YGR187C 1185 nt6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms