Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP4A11Q02928 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CYP4A11Q02928 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP4A11Q02928 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP4A11Q02928 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms