Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ank1Q02357 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ank1Q02357 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ank1Q02357 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ank1Q02357 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms