Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme2Q01768 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme2Q01768 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme2Q01768 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme2Q01768 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme2Q01768 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme2Q01768 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme2Q01768 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme2Q01768 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme2Q01768 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms