Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL8P80075 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL8P80075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL8P80075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL8P80075 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL8P80075 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL8P80075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL8P80075 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL8P80075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL8P80075 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL8P80075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL8P80075 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL8P80075 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL8P80075 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL8P80075 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL8P80075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL8P80075 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL8P80075 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL8P80075 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL8P80075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL8P80075 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL8P80075 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL8P80075 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL8P80075 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL8P80075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL8P80075 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL8P80075 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL8P80075 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL8P80075 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL8P80075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL8P80075 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL8P80075 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL8P80075 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCL8P80075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL8P80075 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL8P80075 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL8P80075 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL8P80075 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL8P80075 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL8P80075 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL8P80075 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL8P80075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL8P80075 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL8P80075 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL8P80075 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL8P80075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL8P80075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL8P80075 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL8P80075 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL8P80075 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL8P80075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL8P80075 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL8P80075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL8P80075 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL8P80075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL8P80075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL8P80075 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL8P80075 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL8P80075 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL8P80075 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL8P80075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL8P80075 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL8P80075 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL8P80075 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL8P80075 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL8P80075 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL8P80075 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL8P80075 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL8P80075 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL8P80075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL8P80075 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL8P80075 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL8P80075 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL8P80075 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms