Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc6P62334 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc6P62334 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc6P62334 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc6P62334 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms