Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1bbP56400 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1bbP56400 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gp1bbP56400 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1bbP56400 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.5 ms