Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIG4P49917 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIG4P49917 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIG4P49917 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIG4P49917 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIG4P49917 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIG4P49917 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIG4P49917 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIG4P49917 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIG4P49917 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIG4P49917 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIG4P49917 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIG4P49917 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIG4P49917 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIG4P49917 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LIG4P49917 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIG4P49917 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LIG4P49917 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIG4P49917 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIG4P49917 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIG4P49917 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIG4P49917 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIG4P49917 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIG4P49917 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIG4P49917 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIG4P49917 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIG4P49917 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LIG4P49917 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LIG4P49917 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIG4P49917 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIG4P49917 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIG4P49917 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIG4P49917 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIG4P49917 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIG4P49917 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIG4P49917 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIG4P49917 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIG4P49917 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LIG4P49917 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG4P49917 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG4P49917 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG4P49917 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG4P49917 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG4P49917 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG4P49917 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG4P49917 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG4P49917 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG4P49917 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG4P49917 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG4P49917 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG4P49917 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG4P49917 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG4P49917 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG4P49917 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG4P49917 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG4P49917 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG4P49917 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIG4P49917 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG4P49917 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG4P49917 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG4P49917 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms