Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cox8bP48772 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms