Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmx3P42581 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hmx3P42581 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmx3P42581 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms