Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P20040 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P20040 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P20040 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P20040 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P20040 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
P20040 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P20040 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P20040 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms