Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsaP16675 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsaP16675 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsaP16675 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsaP16675 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsaP16675 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsaP16675 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsaP16675 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsaP16675 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsaP16675 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsaP16675 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsaP16675 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtsaP16675 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtsaP16675 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsaP16675 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsaP16675 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms