Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms