Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn1O88704 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Hcn1O88704 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Hcn1O88704 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hcn1O88704 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Hcn1O88704 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Hcn1O88704 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Hcn1O88704 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Hcn1O88704 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn1O88704 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Hcn1O88704 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Hcn1O88704 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn1O88704 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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