Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vti1bO88384 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vti1bO88384 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vti1bO88384 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vti1bO88384 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vti1bO88384 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vti1bO88384 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vti1bO88384 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vti1bO88384 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vti1bO88384 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vti1bO88384 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vti1bO88384 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vti1bO88384 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vti1bO88384 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vti1bO88384 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vti1bO88384 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vti1bO88384 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vti1bO88384 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms