Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mid1O70583 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid1O70583 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid1O70583 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mid1O70583 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1O70583 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1O70583 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mid1O70583 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms