Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SpibO35906 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SpibO35906 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SpibO35906 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SpibO35906 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SpibO35906 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SpibO35906 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SpibO35906 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SpibO35906 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SpibO35906 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SpibO35906 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SpibO35906 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SpibO35906 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SpibO35906 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SpibO35906 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SpibO35906 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SpibO35906 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SpibO35906 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SpibO35906 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SpibO35906 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SpibO35906 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SpibO35906 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SpibO35906 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SpibO35906 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SpibO35906 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SpibO35906 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SpibO35906 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SpibO35906 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SpibO35906 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SpibO35906 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SpibO35906 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SpibO35906 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SpibO35906 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SpibO35906 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SpibO35906 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SpibO35906 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SpibO35906 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SpibO35906 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SpibO35906 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SpibO35906 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SpibO35906 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SpibO35906 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SpibO35906 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SpibO35906 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SpibO35906 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SpibO35906 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SpibO35906 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SpibO35906 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SpibO35906 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SpibO35906 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SpibO35906 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SpibO35906 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SpibO35906 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SpibO35906 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SpibO35906 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SpibO35906 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpibO35906 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpibO35906 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpibO35906 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpibO35906 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpibO35906 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SpibO35906 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SpibO35906 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SpibO35906 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SpibO35906 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SpibO35906 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SpibO35906 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SpibO35906 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SpibO35906 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SpibO35906 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SpibO35906 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SpibO35906 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpibO35906 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpibO35906 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpibO35906 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpibO35906 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SpibO35906 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SpibO35906 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SpibO35906 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SpibO35906 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SpibO35906 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SpibO35906 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SpibO35906 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SpibO35906 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SpibO35906 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SpibO35906 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SpibO35906 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SpibO35906 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms