Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEFVO15553 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEFVO15553 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEFVO15553 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEFVO15553 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEFVO15553 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEFVO15553 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEFVO15553 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEFVO15553 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEFVO15553 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEFVO15553 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEFVO15553 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEFVO15553 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEFVO15553 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEFVO15553 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEFVO15553 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEFVO15553 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEFVO15553 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEFVO15553 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEFVO15553 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEFVO15553 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEFVO15553 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEFVO15553 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEFVO15553 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MEFVO15553 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEFVO15553 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEFVO15553 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEFVO15553 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEFVO15553 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEFVO15553 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEFVO15553 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEFVO15553 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEFVO15553 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEFVO15553 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEFVO15553 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MEFVO15553 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MEFVO15553 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEFVO15553 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEFVO15553 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEFVO15553 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEFVO15553 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEFVO15553 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEFVO15553 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEFVO15553 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEFVO15553 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEFVO15553 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEFVO15553 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEFVO15553 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEFVO15553 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEFVO15553 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEFVO15553 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEFVO15553 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEFVO15553 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEFVO15553 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEFVO15553 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEFVO15553 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEFVO15553 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEFVO15553 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MEFVO15553 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MEFVO15553 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEFVO15553 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEFVO15553 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEFVO15553 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEFVO15553 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEFVO15553 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEFVO15553 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEFVO15553 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEFVO15553 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEFVO15553 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEFVO15553 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEFVO15553 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MEFVO15553 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEFVO15553 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEFVO15553 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEFVO15553 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEFVO15553 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEFVO15553 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEFVO15553 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEFVO15553 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEFVO15553 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms