Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ltbp2O08999 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ltbp2O08999 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ltbp2O08999 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ltbp2O08999 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms