Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG4

H2-T24, Histocompatibility 2, T region locus 24, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T24F8VQG4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-T24F8VQG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2-T24F8VQG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2-T24F8VQG4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-T24F8VQG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T24F8VQG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms