Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rfx7F8VPJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rfx7F8VPJ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rfx7F8VPJ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rfx7F8VPJ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rfx7F8VPJ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms