Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fndc1E9Q043 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fndc1E9Q043 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fndc1E9Q043 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fndc1E9Q043 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fndc1E9Q043 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fndc1E9Q043 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fndc1E9Q043 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fndc1E9Q043 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms