Protein–RNA interactions for Protein: E9PZF0

Gm20390, Nucleoside diphosphate kinase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20390E9PZF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20390E9PZF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20390E9PZF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20390E9PZF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20390E9PZF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm20390E9PZF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms