Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Clrn2B2RVW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clrn2B2RVW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clrn2B2RVW2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clrn2B2RVW2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clrn2B2RVW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms