Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem235B1AQL3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem235B1AQL3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem235B1AQL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem235B1AQL3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem235B1AQL3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem235B1AQL3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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