Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa5b1A9Z1V5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b1A9Z1V5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b1A9Z1V5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa5b1A9Z1V5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms