Protein–RNA interactions for Protein: A6NIV6

LRRIQ4, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ4A6NIV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ4A6NIV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ4A6NIV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRIQ4A6NIV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRIQ4A6NIV6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ4A6NIV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms