Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMCO2A6NFE2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMCO2A6NFE2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMCO2A6NFE2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMCO2A6NFE2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms