Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms