Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
PHF8Q9UPP1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms