Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms